Prlic, Andreas: шукати на сайті Z-Library

Найбільша колекція наукових статей у сіті. 70,000,000+ безкоштовних статей.

Пожертвування 15 вересня 2024 – 1 жовтня 2024

Z-Library - одна з найбільших онлайн-бібліотек у світі, в якій зберігається більше 17,000,000 книг та 84,837,000 статей. Ми намагаємось зробити літературу доступною кожному. Сьогодні (15 вересня 2024) ми відкриваємо додатковий збір пожертвувань на підтримку та розвиток проекту.

Також БЕЗЛІМТНІ завантаження (протягом 31 дня після завершення пожертвування) доступні для ВСІХ користувачів, які підтримають проект в період збору коштів до 1 жовтня 2024.

Про збір коштів Детальніше

Підтримати

Книги
Статті (51)
Найпопулярніші
Перелік
- Перелік
- Таблиця

BEAST 2: A Software Platform for Bayesian Evolutionary Analysis

Bouckaert, Remco, Heled, Joseph, Kühnert, Denise, Vaughan, Tim, Wu, Chieh-Hsi, Xie, Dong, Suchard, Marc A., Rambaut, Andrew, Drummond, Alexei J., Prlic, Andreas

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 707 KB

english, 2014

Recon3D enables a three-dimensional view of gene variation in human metabolism

Brunk, Elizabeth, Sahoo, Swagatika, Zielinski, Daniel C, Altunkaya, Ali, Dräger, Andreas, Mih, Nathan, Gatto, Francesco, Nilsson, Avlant, Preciat Gonzalez, German Andres, Aurich, Maike Kathrin, Prlić,

Журнал:

Nature Biotechnology

Рік:

2018

Мова:

english

Файл:

PDF, 6.22 MB

english, 2018

BioJava-ModFinder: identification of protein modifications in 3D structures from the Protein Data Bank

Gao, Jianjiong, Prlić, Andreas, Bi, Chunxiao, Bluhm, Wolfgang F., Dimitropoulos, Dimitris, Xu, Dong, Bourne, Philip E., Rose, Peter W.

Журнал:

Bioinformatics

Рік:

2017

Мова:

english

Файл:

PDF, 321 KB

english, 2017

hgvs: A Python package for manipulating sequence variants using HGVS nomenclature: 2018 Update

Wang, Meng, Callenberg, Keith M., Dalgleish, Raymond, Fedtsov, Alexandre, Fox, Naomi, Freeman, Peter J., Jacobs, Kevin B., Kaleta, Piotr, McMurry, Andrew J., Prlić, Andreas, Rajaraman, Veena, Hart, Re

Журнал:

Human Mutation

Рік:

2018

Файл:

PDF, 1.08 MB

2018

Sustained performance of knowledge-based potentials in fold recognition

Francisco S. Domingues, Walter A. Koppensteiner, Markus Jaritz, Andreas Prlic, Christian Weichenberger, Markus Wiederstein, Hannes Floeckner, Peter Lackner, Manfred J. Sippl

Журнал:

Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics

Рік:

1999

Мова:

english

Файл:

PDF, 282 KB

english, 1999

Assessment of the CASP4 fold recognition category

Manfred J. Sippl, Peter Lackner, Francisco S. Domingues, Andreas Prlić, Rainer Malik, Antonina Andreeva, Markus Wiederstein

Журнал:

Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics

Рік:

2001

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.12 MB

english, 2001

New tools and expanded data analysis capabilities at the protein structure prediction center

Andriy Kryshtafovych, Andreas Prlic, Zinoviy Dmytriv, Pawel Daniluk, Maciej Milostan, Volker Eyrich, Tim Hubbard, Krzysztof Fidelis

Журнал:

Proteins: Structure, Function, and Bioinformatics

Рік:

2007

Мова:

english

Файл:

PDF, 804 KB

english, 2007

The evolution of the RCSB Protein Data Bank website

Philip E. Bourne, Bojan Beran, Chunxiao Bi, Wolfgang F. Bluhm, Dimitris Dimitropoulos, Zukang Feng, David S. Goodsell, Andreas Prlić, Gregory B. Quinn, Peter W. Rose, John Westbrook, Benjamin Yukich,

Журнал:

Wiley Interdisciplinary Reviews: Computational Molecular Science

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 263 KB

english, 2011

Integration of open access literature into the RCSB Protein Data Bank using BioLit

Andreas Prlić, Marco A Martinez, Dimitris Dimitropoulos, Bojan Beran, Benjamin T Yukich, Peter W Rose, Philip E Bourne, J Lynn Fink

Журнал:

BMC Bioinformatics

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.29 MB

english, 2010

Integrating sequence and structural biology with DAS

Andreas Prlić, Thomas A Down, Eugene Kulesha, Robert D Finn, Andreas Kähäri, Tim JP Hubbard

Журнал:

BMC Bioinformatics

Рік:

2007

Мова:

english

Файл:

PDF, 630 KB

english, 2007

Trendspotting in the Protein Data Bank

Berman, Helen M., Coimbatore Narayanan, Buvaneswari, Costanzo, Luigi Di, Dutta, Shuchismita, Ghosh, Sutapa, Hudson, Brian P., Lawson, Catherine L., Peisach, Ezra, Prlić, Andreas, Rose, Peter W., Shao,

Журнал:

FEBS Letters

Рік:

2013

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.64 MB

english, 2013

Automated Tracking of Whiskers in Videos of Head Fixed Rodents

Clack, Nathan G., O'Connor, Daniel H., Huber, Daniel, Petreanu, Leopoldo, Hires, Andrew, Peron, Simon, Svoboda, Karel, Myers, Eugene W., Prlic, Andreas

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.99 MB

english, 2012

Systematic Detection of Internal Symmetry in Proteins Using CE-Symm

Myers-Turnbull, Douglas, Bliven, Spencer E., Rose, Peter W., Aziz, Zaid K., Youkharibache, Philippe, Bourne, Philip E., Prlić, Andreas

Журнал:

Journal of Molecular Biology

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.23 MB

english, 2014

ClonalFrameML: Efficient Inference of Recombination in Whole Bacterial Genomes

Didelot, Xavier, Wilson, Daniel J., Prlic, Andreas

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.71 MB

english, 2015

A Real-Time All-Atom Structural Search Engine for Proteins

Gonzalez, Gabriel, Hannigan, Brett, DeGrado, William F., Prlic, Andreas

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.45 MB

english, 2014

A Toolbox for Representational Similarity Analysis

Nili, Hamed, Wingfield, Cai, Walther, Alexander, Su, Li, Marslen-Wilson, William, Kriegeskorte, Nikolaus, Prlic, Andreas

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.29 MB

english, 2014

Software for Computing and Annotating Genomic Ranges

Lawrence, Michael, Huber, Wolfgang, Pagès, Hervé, Aboyoun, Patrick, Carlson, Marc, Gentleman, Robert, Morgan, Martin T., Carey, Vincent J., Prlic, Andreas

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2013

Мова:

english

Файл:

PDF, 520 KB

english, 2013

ProteinHistorian: Tools for the Comparative Analysis of Eukaryote Protein Origin

Capra, John A., Williams, Alexander G., Pollard, Katherine S., Prlic, Andreas

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 661 KB

english, 2012

eMatchSite: Sequence Order-Independent Structure Alignments of Ligand Binding Pockets in Protein Models

Brylinski, Michal, Prlic, Andreas

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.96 MB

english, 2014

rDock: A Fast, Versatile and Open Source Program for Docking Ligands to Proteins and Nucleic Acids

Ruiz-Carmona, Sergio, Alvarez-Garcia, Daniel, Foloppe, Nicolas, Garmendia-Doval, A. Beatriz, Juhos, Szilveszter, Schmidtke, Peter, Barril, Xavier, Hubbard, Roderick E., Morley, S. David, Prlic, Andrea

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 270 KB

english, 2014

Will Widgets and Semantic Tagging Change Computational Biology?

Bourne, Philip E., Beran, Bojan, Bi, Chunxiao, Bluhm, Wolfgang, Dunbrack, Roland, Prlić, Andreas, Quinn, Greg, Rose, Peter, Shah, Raship, Tao, Wendy, Weitzner, Brian, Yukich, Ben, Nussinov, Ruth

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2010

Мова:

english

Файл:

PDF, 432 KB

english, 2010

The PLOS Computational Biology Software Section

Prlić, Andreas, Lapp, Hilmar

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 120 KB

english, 2012

VBA: A Probabilistic Treatment of Nonlinear Models for Neurobiological and Behavioural Data

Daunizeau, Jean, Adam, Vincent, Rigoux, Lionel, Prlic, Andreas

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 3.23 MB

english, 2014

NESmapper: Accurate Prediction of Leucine-Rich Nuclear Export Signals Using Activity-Based Profiles

Kosugi, Shunichi, Yanagawa, Hiroshi, Terauchi, Ryohei, Tabata, Satoshi, Prlic, Andreas

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.98 MB

english, 2014

Using Biological Pathway Data with Paxtools

Demir, Emek, Babur, Özgün, Rodchenkov, Igor, Aksoy, Bülent Arman, Fukuda, Ken I., Gross, Benjamin, Sümer, Onur Selçuk, Bader, Gary D., Sander, Chris, Prlic, Andreas

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2013

Мова:

english

Файл:

PDF, 449 KB

english, 2013

Ten Simple Rules for the Open Development of Scientific Software

Prlić, Andreas, Procter, James B.

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 133 KB

english, 2012

CeleST: Computer Vision Software for Quantitative Analysis of C. elegans Swim Behavior Reveals Novel Features of Locomotion

Restif, Christophe, Ibáñez-Ventoso, Carolina, Vora, Mehul M., Guo, Suzhen, Metaxas, Dimitris, Driscoll, Monica, Prlic, Andreas

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.95 MB

english, 2014

Podbat: A Novel Genomic Tool Reveals Swr1-Independent H2A.Z Incorporation at Gene Coding Sequences through Epigenetic Meta-Analysis

Sadeghi, Laia, Bonilla, Carolina, Strålfors, Annelie, Ekwall, Karl, Svensson, J. Peter, Prlić, Andreas

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2011

Мова:

english

Файл:

PDF, 484 KB

english, 2011

OpenCyto: An Open Source Infrastructure for Scalable, Robust, Reproducible, and Automated, End-to-End Flow Cytometry Data Analysis

Finak, Greg, Frelinger, Jacob, Jiang, Wenxin, Newell, Evan W., Ramey, John, Davis, Mark M., Kalams, Spyros A., De Rosa, Stephen C., Gottardo, Raphael, Prlic, Andreas

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2014

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.37 MB

english, 2014

RELATION BETWEEN MAJOR AND MINOR DEPRESSION AND HEART RATE, HEART-RATE VARIABILITY, AND CLINICAL CHARACTERISTICS OF PATIENTS WITH ACUTE CORONARY SYNDROME 1

ČATIPOVIĆ-VESELICA, KATIJA, GALIĆ, ANDREA, JELIĆ, KREŠIMIR, GLAVAŠ, VEDRANA BARABAN, ŠARIĆ, SANDRA, PRLIĆ, NADA, ČATIPOVIĆ, BRANIMIR

Журнал:

Psychological Reports

Рік:

2007

Мова:

english

Файл:

PDF, 425 KB

english, 2007

Estimating Reliability of Predicted Open Reading Frames for C. elegans

Prlic, Andreas, Domingues, Francisco S., Sippl, Manfred J.

Журнал:

Biochemical Society Transactions

Рік:

2000

Мова:

english

Файл:

PDF, 112 KB

english, 2000

[ACM Press the 21st International Conference - Anaheim, California (2016.07.22-2016.07.24)] Proceedings of the 21st International Conference on Web3D Technology - Web3D '16 - Web-based molecular graphics for large complexes

Rose, Alexander S., Bradley, Anthony R., Valasatava, Yana, Duarte, Jose M., Prlić, Andreas, Rose, Peter W.

Рік:

2016

Мова:

english

Файл:

PDF, 719 KB

english, 2016

Mapping genetic variations to three-dimensional protein structures to enhance variant interpretation: a proposed framework

Glusman, Gustavo, Rose, Peter W., Prlić, Andreas, Dougherty, Jennifer, Duarte, José M., Hoffman, Andrew S., Barton, Geoffrey J., Bendixen, Emøke, Bergquist, Timothy, Bock, Christian, Brunk, Elizabeth,

Журнал:

Genome Medicine

Рік:

2017

Мова:

english

Файл:

PDF, 456 KB

english, 2017

NGL Viewer: Web-based molecular graphics for large complexes

Rose, Alexander S, Bradley, Anthony R, Valasatava, Yana, Duarte, Jose M, Prlić, Andreas, Rose, Peter W

Журнал:

Bioinformatics

Рік:

2018

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.42 MB

english, 2018

ARACHNE: A neural-neuroglial network builder with remotely controlled parallel computing

Aleksin, Sergey G., Zheng, Kaiyu, Rusakov, Dmitri A., Savtchenko, Leonid P., Prlic, Andreas

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2017

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.22 MB

english, 2017

Porcupine: A visual pipeline tool for neuroimaging analysis

van Mourik, Tim, Snoek, Lukas, Knapen, Tomas, Norris, David G., Prlic, Andreas

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2018

Мова:

english

Файл:

PDF, 7.78 MB

english, 2018

Getting More Out of Biomedical Documents with GATE's Full Lifecycle Open Source Text Analytics

Cunningham, Hamish, Tablan, Valentin, Roberts, Angus, Bontcheva, Kalina, Prlic, Andreas

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2013

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.64 MB

english, 2013

Circular Permutation in Proteins

Bliven, Spencer, Prlić, Andreas, Wodak, Shoshana

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2012

Мова:

english

Файл:

PDF, 327 KB

english, 2012

Wham: Identifying Structural Variants of Biological Consequence

Kronenberg, Zev N., Osborne, Edward J., Cone, Kelsey R., Kennedy, Brett J., Domyan, Eric T., Shapiro, Michael D., Elde, Nels C., Yandell, Mark, Prlic, Andreas

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 2.56 MB

english, 2015

Visualization of Metabolic Interaction Networks in Microbial Communities Using VisANT 5.0

Granger, Brian R., Chang, Yi-Chien, Wang, Yan, DeLisi, Charles, Segrè, Daniel, Hu, Zhenjun, Prlic, Andreas

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2016

Мова:

english

Файл:

PDF, 732 KB

english, 2016

SINCERA: A Pipeline for Single-Cell RNA-Seq Profiling Analysis

Guo, Minzhe, Wang, Hui, Potter, S. Steven, Whitsett, Jeffrey A., Xu, Yan, Prlic, Andreas

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2015

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.80 MB

english, 2015

MMTF—An efficient file format for the transmission, visualization, and analysis of macromolecular structures

Bradley, Anthony R., Rose, Alexander S., Pavelka, Antonín, Valasatava, Yana, Duarte, Jose M., Prlić, Andreas, Rose, Peter W., Schneidman, Dina

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2017

Мова:

english

Файл:

PDF, 5.80 MB

english, 2017

kWIP: The k-mer weighted inner product, a de novo estimator of genetic similarity

Murray, Kevin D., Webers, Christfried, Ong, Cheng Soon, Borevitz, Justin, Warthmann, Norman, Prlic, Andreas

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2017

Мова:

english

Файл:

PDF, 4.60 MB

english, 2017

Automatic analysis and 3D-modelling of Hi-C data using TADbit reveals structural features of the fly chromatin colors

Serra, François, Baù, Davide, Goodstadt, Mike, Castillo, David, Filion, Guillaume J., Marti-Renom, Marc A., Prlic, Andreas

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2017

Мова:

english

Файл:

PDF, 13.88 MB

english, 2017

Impact of genetic variation on three dimensional structure and function of proteins

Bhattacharya, Roshni, Rose, Peter W., Burley, Stephen K., Prlić, Andreas, Zhang, Yang

Журнал:

PLoS ONE

Рік:

2017

Мова:

english

Файл:

PDF, 3.39 MB

english, 2017

Towards an efficient compression of 3D coordinates of macromolecular structures

Valasatava, Yana, Bradley, Anthony R., Rose, Alexander S., Duarte, Jose M., Prlić, Andreas, Rose, Peter W., Salsbury, Freddie

Журнал:

PLoS ONE

Рік:

2017

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.31 MB

english, 2017

Tellurium notebooks—An environment for reproducible dynamical modeling in systems biology

Medley, J. Kyle, Choi, Kiri, König, Matthias, Smith, Lucian, Gu, Stanley, Hellerstein, Joseph, Sealfon, Stuart C., Sauro, Herbert M., Prlic, Andreas

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2018

Мова:

english

Файл:

PDF, 6.85 MB

english, 2018

hgvs: A Python package for manipulating sequence variants using HGVS nomenclature: 2018 Update

Журнал:

Human Mutation

Рік:

2018

Мова:

english

Файл:

PDF, 1.08 MB

english, 2018

Investigation of protein quaternary structure via stoichiometry and symmetry ınformation

Korkmaz, Selcuk, Duarte, Jose M., Prlić, Andreas, Goksuluk, Dincer, Zararsiz, Gokmen, Saracbasi, Osman, Burley, Stephen K., Rose, Peter W., Zhang, Yang

Журнал:

PLoS ONE

Рік:

2018

Мова:

english

Файл:

PDF, 10.50 MB

english, 2018

BioJava 5: A community driven open-source bioinformatics library

Lafita, Aleix, Bliven, Spencer, Prlić, Andreas, Guzenko, Dmytro, Rose, Peter W., Bradley, Anthony, Pavan, Paolo, Myers-Turnbull, Douglas, Valasatava, Yana, Heuer, Michael, Larson, Matt, Burley, Stephe

Журнал:

PLoS Computational Biology

Рік:

2019

Файл:

PDF, 2.31 MB

2019